AutoDock是一套自动对接工具。
它被设计用来预测小分子，如底物或候选药物，如何与已知3D结构的受体结合。
多年来，它已经被修改和改进以添加新的功能，并且已经开发了多个引擎。
当前的AutoDock发行版包括两代软件:AutoDock 4和AutoDock Vina。
最近，我们开发了AutoDock-GPU，这是AutoDock4的加速版本，比原来的单cpu对接代码快数百倍。
AutoDock 4实际上由两个主要程序组成:AutoDock执行配体与一组描述目标蛋白质的网格的对接;Autogrid预先计算这些网格。
除了使用它们进行对接之外，原子亲和网格还可以可视化。
这可以帮助，例如，指导有机合成化学家设计更好的粘合剂。
AutoDock Vina不需要为它们选择原子类型和预先计算网格地图。
相反，它在内部为所需的原子类型计算网格，并且几乎立即完成。
我们还开发了一个名为AutoDockTools的图形用户界面，简称ADT，它有助于设置配体中哪些键可旋转，并分析对接。
AutoDock的应用领域包括：